Anche quest'opera, come altre del Caravaggio, è stata rifiutata dai committenti nella prima sua versione perché carica di realismo e di forte audacia, come testimoniano le radiografie che riscontrano un San Paolo con le testa reclinata all'indietro mettendo in evidenze la sua forte agitazione. Questa prima versione (corretta dallo stesso Caravaggio) è stata recentemente esposta al pubblico per la prima volta nella stessa basilica ed è stato così possibile vedere le due opere a confronto.

Da non confondere quest'opera con la "Conversione di San Paolo" della collezione Odalisca Balbi, di cui attualmente (siamo al giugno 2010) il presidente del consiglio Silvio Berlusconi sta trattandone l'acquisto.