Le raffigurazioni delle lunette del chiostro grande, attualmente custodite nel Museo della Certosa, riportavano - considerando l'ordine di riferimento scritto dal Vasari - "l'Orazione nell'orto" (a sud-ovest), "Cristo dinanzi a Filato" (contiguo al lato ovest), "la Resurrezione" (a nord-ovest), "l'Andata al Calvario" (a sud-est), "la Deposizione" (a nord). Il Vasari nei suoi scritti, a proposito dell'intera opera, evidenzia la sorprendente svolta stilistica dell'artista che, influenzato dalla "Passione" del Dürer, si impegna a tutto campo ad assorbire la maniera della pittura nordica.

Il Toesca nel 1943 riferisce che "il pittore che a Poggio a Calano aveva trovato impressioni cosi semplici, spontanee e sensuali, [qui] diventa ad un tratto un puro cerebrale. Invece di cercare dentro di sé il movente della sua arte, lo cerca al di fuori, nelle opere altrui [...] scomparsa l'aria, la libertà, la gaiezza della campagna di Poggio a Calano, egli si lascia trascinare in piena astrazione".

Esistono i disegni originali relativi alle "Storie della passione", tra i quali, alcuni sono custoditi agli Uffizi, altri a Roma, a Venezia e a Marsiglia (fonte: Janet Cox Rearick, 1964).