La crocifissione è il tema più frequente e viene raffigurato sempre in diversi modi, talvolta insieme alla Madonna e a San Giovanni. Nella sua pittura giovanile si riconosce l’influenza del Mantegna, suo cognato, pittore a lui molto vicino. Si riconoscono, soprattutto nell’Orazione dell’orto, l’arte della prospettiva negli scorci, la resa volumetrica del figurativo, il risalto e l’importanza dei contorni e gli elaborati schemi di composizione del Mantegna.  Più avanti, Bellini riuscirà a distaccarsi, anche se non del tutto, dagli insegnamenti del cognato raggiungendo una propria maturità stilistica caratterizzata dalla particolare luminosità, dall’armonia delle gamme cromatiche, dalla sua grandissima sensibilità verso il paesaggio naturale e dalla capacità di lanciare forti segnali emozionali con le sue figure. Alcuni critici leggono nelle sue opere un plasticismo di sapore metafisico come nei lavori di Piero della Francesca ed un esasperato realismo umano come nei lavori di Antonello da Messina. Si svilupperà ulteriormente, con il passare degli anni, il suo schema di composizione che lo porterà ad essere l’unico protagonista del suo tempo. Il suo stile raggiunge la completa maturazione agli inizi del Cinquecento; la sua tecnica preferita è sempre più spesso quella della tempera ed i suoi lavori saranno le famose pale d'altare raffiguranti la Madonna in trono circondata dai santi, dove le figure, i paesaggi e le architetture si compongono in un perfetto equilibrio di curve di luce e di emozioni.